Forschungsgruppe Platzer

Genomanalyse

Genomik komplexer Erkrankungen, des Alterns und von Modellorganismen

Gemeinsam mit klinischen Partnern arbeiten wir an der Detektion und funktionellen Analyse genetischer & epigenetischer Variationen, die das individuelle Risiko für komplexe Erkrankungen (Entzündungen, Infektionen, Krebs, Fettsucht), und Alterung bestimmen. Wir liefern Beiträge zur vergleichenden & funktionellen Genomanalyse biomedizinisch interessanter Eukaryoten und untersuchen ausgewählte Prokaryoten- & Metagenome. Im Rahmen internationaler Projekte waren wir an der Sequenzanalyse der menschlichen Chromosomen 8 und X sowie des Genoms der sozialen Amöbe Dictyostelium discoideum beteiligt.

Projekte (ausgewählt)

» Der "Stammbaum" von Ernst Haeckel (1874).

Genomanalyse und Mutagenese des kurzlebigsten bekannten Wirbeltiers - Prachtgrundkärpfling Nothobranchius furzeri (WGL-Pakt) » mehr
Bedeutung genomischer Variationen und DNA-Methylierung für Langlebigkeit (mehr) und Übergewicht (LGSA) beim Menschen
Kopienzahl- & Sequenzvariationen der Defensin-Gene bei Krebs (Wilhelm-Sander-Stiftung) und Entzündung
Genetische Veranlagung für umweltbedingte Erkrankungen, wie chronische entzündliche Darmerkrankungen und Sarkoidose (NGFN)
Alternatives Spleißen als evolutionärer Prozess zur Vergrößerung der Proteomvariabilität (DFG) und als Modulator der Signalübertragung (SFB604)
Von komparativer zur funktionellen Genomik sozialer Amöben (DFG) » mehr
Funktionelle Genomanalyse von pathogenen Dermatophyten (WGL-Pakt) » mehr
Aufklärung des Gerstegenoms: Verankerung der physischen Karte mittles explorativer Genomsequenzierung (BARLEX)

Ausgewählte Publikationen

Siddiqui R A, Sauermann U, Altmuller J, Fritzer E, Nothnagel M, Dalibor N, Fellay J, Kaup F J, Stahl-Hennig C, Nurnberg P, Krawczak M, Platzer M. (2009) X chromosomal variation is associated with slow progression to AIDS in HIV-1-infected women. Am J Hum Genet 2009, 85, 228-239 [PubMed]
Reichwald K, Lauber C, Nanda I, Kirschner J, Hartmann N, Schories S, Gausmann U, Taudien S, Schilhabel M B, Szafranski K, Glockner G, Schmid M, Cellerino A, Schartl M, Englert C, Platzer M (2009) High tandem repeat content in the genome of the short-lived annual fish Nothobranchius furzeri: a new vertebrate model for aging research. Genome Biol. 10, R16.[PubMed]
Heidel AJ, Glöckner G (2008) Mitochondrial genome evolution in the social amoebae. Mol Biol Evol. 25, 1440-1450. [PubMed]
Hiller M, Platzer M (2008) Widespread and subtle: alternative splicing at short-distance tandem sites. Trends Genet. 24, 246-255. [PubMed]
Nguyen T, Ishida K, Jenke-Kodama H, Dittmann E, Gurgui C, Hochmuth T, Taudien S, Platzer M, Hertweck C, Piel J (2008) Exploiting the mosaic structure of trans-acyltransferase polyketide synthases for natural product discovery and pathway dissection. Nat Biotechnol. 26, 225-233. [PubMed]

Last update: August 21, 2009

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