Gruppenleiter


Matthias Platzer
Matthias Platzer

Postdocs-PI

Klaus Huse

Postdocs

Bryan Downie

Marius Felder

Marco Groth

Andrew Heidel

Kathrin Reichwald

Karol Szafranski

Stefan Taudien

Doktoranden

Ogechukwu Brenda Agba

Philipp Koch

Andreas Petzold

Masterstudenten

Eileen Powalsky

Monique Riedel

Technische Assistenten / Ingenieure

Susanne Fabisch

Silke Förste

Ivonne Görlich

Ivonne Heinze

Niels Jahn

Hella Ludewig

Cornelia Luge

Bernd Senf

Juliane Waentig

Nadine Zeise

Gäste

Marcel Kramer

Kolsoum Inanloo Rahatloo

Christoph Sponholz

Beate Szafranski

Xianghong Thang



 

Forschungsgruppe Platzer

Genomanalyse

Genomik des Alterns, komplexer Erkrankungen und von Modellorganismen

Gemeinsam mit klinischen Partnern arbeiten wir an der Detektion und funktionellen Analyse genetischer und epigenetischer Variationen, die die individuellen Anlagen für das Altern und alternsbedingte Erkrankungen ausmachen. Wir liefern Beiträge zur funktionellen und vergleichenden Analyse biomedizinisch interessanter Modell- und Nicht-Modellgenome und -transkriptome.

 

Projekte (ausgewählt)

The genealogical tree of Haeckel (1874)

» Der "Stammbaum" von Ernst Haeckel (1874).

  • Genomanalyse des kurzlebigsten bekannten Wirbeltiers - Prachtgrundkärpfling Nothobranchius furzeri » mehr
  • Erforschung natürlicher Wege zur Ausdehnung der Gesundheitsspanne bei extrem langlebigen Sandgräbern (Bathyergidae) » mehr
  • Milder Stress und gesundes Altern - vergleichende Transkriptomanalyse im Rahmen des Jenaer Zentrums für Systembiologie des Alterns » JenAge
  • Bedeutung genomischer Variationen und DNA-Methylierung für das Altern des Gehirns
    (EU / BrainAGE) und für Übergewicht » mehr
  • Genetische Anlagen für umwelt- und alternsbedingte Erkrankungen (chronisch-entzündliche Darmerkrankungen, Sepsis [SEPTOMICS / CSCC], Psoriasis) mit Schwerpunkt auf Kopienzahl- und Sequenzvariationen humaner Defensin-Gene
  • Unterstützung von Kooperationsprojekten durch genomische Expertise: Erkundung von Triticeae-Genomen mittels massiv-paralleler Sequenzierung (BARLEX / TRITEX); Olfaktorische Partnerwahl bei Fledermäusen und Hyänen (PAKT / IZW)
  • Entwicklung von bioinformatischen Verfahren zur Assemblierung und Repeat-Annotation komplexer Genome (Klaus-Tschira-Stiftung) und deren Transkriptome » mehr

 

Ausgewählte Publikationen

  • Heidel A, Lawal H, Felder M, Schilde C, Helps N, Tunggal B, Rivero F, John U, Schleicher M, Eichinger L, Platzer M, Noegel A, Schaap P, Glöckner G. Phylogeny-wide analysis of social amoeba genomes highlights ancient origins for complex intercellular communication. Genome Res, 2011. [Sep 15. Epub ahead of print]
  • Mayer K F, Martis M, Hedley P E, Simkova H, Liu H, Morris J A, Steuernagel B, Taudien S, Roessner S, Gundlach H, Kubalakova M, Suchankova P, Murat F, Felder M, Nussbaumer T, Graner A, Salse J, Endo T, Sakai H, Tanaka T, Itoh T, Sato K, Platzer M, Matsumoto T, Scholz U, Dolezel J, Waugh R, Stein N. Unlocking the Barley Genome by Chromosomal and Comparative Genomics. Plant Cell 2011, 23, 1249-1263. [PubMed]
  • Groth M, Wiegand C, Szafranski K, Huse K, Kramer M, Rosenstiel P, Schreiber S, Norgauer J, Platzer M. Both copy number and sequence variations affect expression of human DEFB4. Genes Immun 2010, 11, 458-466. [PubMed]
  • Reichwald K, Lauber C, Nanda I, Kirschner J, Hartmann N, Schories S, Gausmann U, Taudien S, Schilhabel M B, Szafranski K, Glockner G, Schmid M, Cellerino A, Schartl M, Englert C, Platzer M (2009) High tandem repeat content in the genome of the short-lived annual fish Nothobranchius furzeri: a new vertebrate model for aging research. Genome Biol, 10, R16. [PubMed]
  • Siddiqui R A, Sauermann U, Altmuller J, Fritzer E, Nothnagel M, Dalibor N, Fellay J, Kaup F J, Stahl-Hennig C, Nurnberg P, Krawczak M, Platzer M. (2009) X chromosomal variation is associated with slow progression to AIDS in HIV-1-infected women. Am J Hum Genet 2009, 85, 228-239. [PubMed]

 


Last update: January 16th, 2012

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