Forschungsgruppe Platzer

Genomanalyse

Genomik des Alterns, komplexer Erkrankungen und von Modellorganismen

Gemeinsam mit klinischen Partnern arbeiten wir an der Detektion und funktionellen Analyse genetischer und epigenetischer Variationen, die die individuellen Anlagen für das Altern und alternsbedingte Erkrankungen ausmachen. Wir liefern Beiträge zur funktionellen und vergleichenden Analyse biomedizinisch interessanter Modell- und Nicht-Modellgenome und -transkriptome.

Projekte (ausgewählt)

» Der "Stammbaum" von Ernst Haeckel (1874).

Genomanalyse des kurzlebigsten bekannten Wirbeltiers - Prachtgrundkärpfling Nothobranchius furzeri » mehr
Erforschung natürlicher Wege zur Ausdehnung der Gesundheitsspanne bei extrem langlebigen Sandgräbern (Bathyergidae) » mehr
Milder Stress und gesundes Altern - vergleichende Transkriptomanalyse im Rahmen des Jenaer Zentrums für Systembiologie des Alterns » JenAge
Bedeutung genomischer Variationen und DNA-Methylierung für das Altern des Gehirns
(EU / BrainAGE) und für Übergewicht » mehr
Genetische Anlagen für umwelt- und alternsbedingte Erkrankungen (chronisch-entzündliche Darmerkrankungen, Sepsis [SEPTOMICS / CSCC], Psoriasis) mit Schwerpunkt auf Kopienzahl- und Sequenzvariationen humaner Defensin-Gene
Unterstützung von Kooperationsprojekten durch genomische Expertise: Erkundung von Triticeae-Genomen mittels massiv-paralleler Sequenzierung (BARLEX / TRITEX); Olfaktorische Partnerwahl bei Fledermäusen und Hyänen (PAKT / IZW)
Entwicklung von bioinformatischen Verfahren zur Assemblierung und Repeat-Annotation komplexer Genome (Klaus-Tschira-Stiftung) und deren Transkriptome » mehr

Ausgewählte Publikationen

Heidel A, Lawal H, Felder M, Schilde C, Helps N, Tunggal B, Rivero F, John U, Schleicher M, Eichinger L, Platzer M, Noegel A, Schaap P, Glöckner G. Phylogeny-wide analysis of social amoeba genomes highlights ancient origins for complex intercellular communication. Genome Res, 2011. [Sep 15. Epub ahead of print]
Mayer K F, Martis M, Hedley P E, Simkova H, Liu H, Morris J A, Steuernagel B, Taudien S, Roessner S, Gundlach H, Kubalakova M, Suchankova P, Murat F, Felder M, Nussbaumer T, Graner A, Salse J, Endo T, Sakai H, Tanaka T, Itoh T, Sato K, Platzer M, Matsumoto T, Scholz U, Dolezel J, Waugh R, Stein N. Unlocking the Barley Genome by Chromosomal and Comparative Genomics. Plant Cell 2011, 23, 1249-1263. [PubMed]
Groth M, Wiegand C, Szafranski K, Huse K, Kramer M, Rosenstiel P, Schreiber S, Norgauer J, Platzer M. Both copy number and sequence variations affect expression of human DEFB4. Genes Immun 2010, 11, 458-466. [PubMed]
Reichwald K, Lauber C, Nanda I, Kirschner J, Hartmann N, Schories S, Gausmann U, Taudien S, Schilhabel M B, Szafranski K, Glockner G, Schmid M, Cellerino A, Schartl M, Englert C, Platzer M (2009) High tandem repeat content in the genome of the short-lived annual fish Nothobranchius furzeri: a new vertebrate model for aging research. Genome Biol, 10, R16. [PubMed]
Siddiqui R A, Sauermann U, Altmuller J, Fritzer E, Nothnagel M, Dalibor N, Fellay J, Kaup F J, Stahl-Hennig C, Nurnberg P, Krawczak M, Platzer M. (2009) X chromosomal variation is associated with slow progression to AIDS in HIV-1-infected women. Am J Hum Genet 2009, 85, 228-239. [PubMed]

Last update: January 16th, 2012

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